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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
04/10/2019 |
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Data da última atualização: |
04/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MOREIRA, G. C. M.; SALVIAN, M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; GODOY, T. F.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; MAYARA SALVIAN, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; ALINE SILVA MELLO CESAR, ESALQ; JAMES M. REECY, Iowa State University/Department of Animal Science; THAIS FERNANDA GODOY, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; DORIAN J. GARRICK, Massey University/ School of Agriculture; GERSON BARRETO MOURÃO, ESALQ; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
Genome-wide association scan for QTL and their positional candidate genes associated with internal organ traits in chickens. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 20, n. 669, 2019. |
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DOI: |
10.1186/s12864-019-6040-3 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Background: Poultry breeding programs have been focused on improvement of growth and carcass traits, however, this has resulted in correlated changes in internal organ weights and increased incidence of metabolic disorders. These disorders can affect feed efficiency or even cause death. We used a high density SNP array (600 K, Affymetrix) to estimate genomic heritability, perform genome-wide association analysis, and identify genomic regions and positional candidate genes (PCGs) associated with internal organ traits in an F2 chicken population. We integrated knowledge of haplotype blocks, selection signature regions and sequencing data to refine the list of PCGs. Results: Estimated genomic heritability for internal organ traits in chickens ranged from low (LUNGWT, 0.06) to high (GIZZWT, 0.45). A total of 20 unique 1 Mb windows identified on GGA1, 2, 4, 7, 12, 15, 18, 19, 21, 27 and 28 were significantly associated with intestine length, and weights or percentages of liver, gizzard or lungs. Within these windows, 14 PCGs were identified based on their biological functions: TNFSF11, GTF2F2, SPERT, KCTD4, HTR2A, RB1, PCDH7, LCORL, LDB2, NR4A2, GPD2, PTPN11, ITGB4 and SLC6A4. From those genes, two were located within haplotype blocks and three overlapped with selection signature regions. A total of 13,748 annotated sequence SNPs were in the 14 PCGs, including 156 SNPs in coding regions (124 synonymous, 26 non-synonymous, and 6 splice variants). Seven deleterious SNPs were identified in TNFSF11, NR4A2 or ITGB4 genes. Conclusions: The results from this study provide novel insights to understand the genetic architecture of internal organ traits in chickens. The QTL detection performed using a high density SNP array covered the whole genome allowing the discovery of novel QTL associated with organ traits. We identified PCGs within the QTL involved in biological processes that may regulate internal organ growth and development. Potential functional genetic variations were identified generating crucial information that, after validation, might be used in poultry breeding programs to reduce the occurrence of metabolic disorders. MenosAbstract Background: Poultry breeding programs have been focused on improvement of growth and carcass traits, however, this has resulted in correlated changes in internal organ weights and increased incidence of metabolic disorders. These disorders can affect feed efficiency or even cause death. We used a high density SNP array (600 K, Affymetrix) to estimate genomic heritability, perform genome-wide association analysis, and identify genomic regions and positional candidate genes (PCGs) associated with internal organ traits in an F2 chicken population. We integrated knowledge of haplotype blocks, selection signature regions and sequencing data to refine the list of PCGs. Results: Estimated genomic heritability for internal organ traits in chickens ranged from low (LUNGWT, 0.06) to high (GIZZWT, 0.45). A total of 20 unique 1 Mb windows identified on GGA1, 2, 4, 7, 12, 15, 18, 19, 21, 27 and 28 were significantly associated with intestine length, and weights or percentages of liver, gizzard or lungs. Within these windows, 14 PCGs were identified based on their biological functions: TNFSF11, GTF2F2, SPERT, KCTD4, HTR2A, RB1, PCDH7, LCORL, LDB2, NR4A2, GPD2, PTPN11, ITGB4 and SLC6A4. From those genes, two were located within haplotype blocks and three overlapped with selection signature regions. A total of 13,748 annotated sequence SNPs were in the 14 PCGs, including 156 SNPs in coding regions (124 synonymous, 26 non-synonymous, and 6 splice variants). Seven deleterious SNPs we... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Deleterious mutations; Genomic heritability; GWAS; Metabolic disorders. |
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Thesagro: |
Avicultura; Genética Animal; Genoma; Melhoramento Genético Animal. |
|
Thesaurus Nal: |
Genomics; Gizzard; Heart; Intestines; Liver; Lungs; Metabolic diseases. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
29/01/2020 |
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Data da última atualização: |
29/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
TOMAS, W. M.; MAGNUSSON, W. E.; MOURAO, G. de M.; BERGALLO, H. G.; LINARES, S. F. T. P.; CRAWSHAW JUNIOR, P. G.; CAMPOS, Z. M. da S.; CAMILO, A. R.; VERDADE, L. M.; TORTATO, F. R.; PERES, C. A. |
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Afiliação: |
WALFRIDO MORAES TOMAS, CPAP; WILLIAM E. MAGNUSSON, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Biodiversidade, Manaus/AM, Brasil; GUILHERME DE MIRANDA MOURAO, CPAP; HELENA G. BERGALLO, Universidade do Estado do Rio de Janeiro; SIMONE FRAGA TENÓRIO P. LINARES, Instituto de Pesquisas Ecológicas, Nazaré Paulista/SP; PETER G. CRAWSHAW JUNIOR, Ecologia e Ação/ECOA; ZILCA MARIA DA SILVA CAMPOS, CPAP; ANDRÉ RESTEL CAMILO, Ecologia e Ação/ECOA; LUCIANO M. VERDADE, Universidade de São Paulo; FERNANDO RODRIGO TORTATO, Universidade Federal de Mato Grosso; CARLOS A. PERES, University of East Anglia. |
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Título: |
Meio século da proibição da caça no Brasil: consequências de uma política inadequada de gestão de vida selvagem. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Biodiversidade Brasileira, v. 8, n. 2, p. 75-81, 2018. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Na publicação: Guilherme Mourão; Zilca Campos. Artigo de opinião. |
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Conteúdo: |
A caça foi proibida no Brasil em 1967, pela lei que ficou conhecida como 'Lei de Proteção à Fauna'. Desde então, nenhuma política efetiva de gestão de fauna foi estabelecida no país. As consequências são graves, uma vez que a caça nunca foi plenamente controlada, e continua sendo comumente praticada em todas as regiões do Brasil. Além disso, o país falhou em educar a população para entender a fauna como recurso importante e valioso, e também em proporcionar seu uso sustentável. As universidades nunca estabeleceram um currículo acadêmico de gestores de fauna capacitados a manejar populações, já que, com a proibição, esse perfil profissional nunca foi considerado uma demanda relevante. O resultado é que a lista de espécies ameaçadas de extinção aumenta a cada nova versão, sendo a caça ilegal uma das principais causas desse processo. O maior país tropical do mundo carece da implantação de uma política abrangente e moderna de gestão de fauna e que seja governada por decisões de cunho técnico-científico e estratégico, ao invés da lógica 'tudo é proibido', que prevalece até hoje. Os objetivos deste artigo de opinião são estimular uma reflexão sobre a situação da caça no Brasil e apontar a necessidade de um sistema de gestão de fauna mais efetivo. |
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Thesagro: |
Caçada; Fauna Silvestre. |
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Thesaurus NAL: |
Wild animals; Wildlife management. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/209851/1/Meio-Seculo-proibicao-2018.pdf
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Marc: |
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520 $aA caça foi proibida no Brasil em 1967, pela lei que ficou conhecida como 'Lei de Proteção à Fauna'. Desde então, nenhuma política efetiva de gestão de fauna foi estabelecida no país. As consequências são graves, uma vez que a caça nunca foi plenamente controlada, e continua sendo comumente praticada em todas as regiões do Brasil. Além disso, o país falhou em educar a população para entender a fauna como recurso importante e valioso, e também em proporcionar seu uso sustentável. As universidades nunca estabeleceram um currículo acadêmico de gestores de fauna capacitados a manejar populações, já que, com a proibição, esse perfil profissional nunca foi considerado uma demanda relevante. O resultado é que a lista de espécies ameaçadas de extinção aumenta a cada nova versão, sendo a caça ilegal uma das principais causas desse processo. O maior país tropical do mundo carece da implantação de uma política abrangente e moderna de gestão de fauna e que seja governada por decisões de cunho técnico-científico e estratégico, ao invés da lógica 'tudo é proibido', que prevalece até hoje. Os objetivos deste artigo de opinião são estimular uma reflexão sobre a situação da caça no Brasil e apontar a necessidade de um sistema de gestão de fauna mais efetivo.
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650 $aCaçada
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700 1 $aMOURAO, G. de M.
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700 1 $aPERES, C. A.
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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